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ある特定のタンパク質と結合するものを細胞破砕液中から見つけ出す。baitにはhisタグがついている。タグ配列を特異的に認識する抗体抗体の非可変部であるFcに結合するproteinA,Gにアガロースビーズをつけておく。これにより、baitとpreyが結合するとアガロースビーズの重さで沈む。※抗原決定基HAtag c-Myc tag Flag tag ※免疫沈降法はファージを用いたスクリーニング等である程度preyを絞ってから使う。
↓細胞に入れる↓細胞を破砕↓免疫沈降後、Western blottingを行う。
特異的な抗体の替わりに、baitタンパク質をプローブとして使用。※質量しかわからない。
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